视频:如何选择进行 ChIP 的酶解法或超声处理实验步骤


Ken B 发布于 2019 年 11 月 06 日 03:00:00

染色质免疫沉淀 (ChIP) 实验能否成功取决于染色质碎裂法,这也是 ChIP 实验步骤中较为关键的一步。通过超声处理或酶解法便可完成这一步。但是如何决定在 ChIP 实验中使用哪一种染色质碎裂法实验步骤呢?很多因素都会影响您的选择,做决定似乎很困难。因此,让我们从简单开始,来看下视频,我们将向您展示该方法!

 

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主题: 实验步骤, ChIP, 技术

制备 ChIP-seq DNA 库。我该从哪里开始呢?


Tamar A. 发布于 2019 年 9 月 18 日 03:15:00

染色质免疫沉淀测序 (ChIP-seq) 是一种灵活而强大的技术,研究人员用于阐明基因调控如何参与不同的生物学事件以及癌症和神经退行性疾病等各种疾病的进展。

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主题: ChIP, 表观遗传学

如何选择进行 ChIP 的酶解法或超声处理实验步骤


Chris S 发布于 2019 年 6 月 26 日 03:10:00

研究人员使用染色质免疫沉淀法,或 ChIP 在染色质环境下检测和表征蛋白与DNA的相互作用。Chip 实验可使用不同的输入样品,染色质碎裂法,并提供 ChIP-qPCR 或 ChIP-seq 读数。

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主题: ChIP, 表观遗传学

“技术提示”视频:我该使用多少抗体来进行 ChIP?


Ken B 发布于 2018 年 11 月 28 日 03:15:00

现在可以查看 CST 技术提示播放列表中的其他视频了!在这一版本的技术提示中,我们将解决客户向我们 ChIP 团队提出的一个关于常见实验步骤的问题:染色质免疫沉淀 (ChIP) 实验需要使用多少抗体。抗体并不总是越多越好 - 观看视频,了解原因。 

无法看到上方嵌入的视频?点击下方的链接播放: 

我该使用多少抗体来进行 ChIP 实验? | CST 技术提示
 

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主题: 实验步骤, 一抗, ChIP, 实验技巧

揭秘 ChIP/ChIP-seq:单克隆抗体与多克隆抗体


Neha G and Ken B 发布于 2018 年 9 月 26 日 03:15:00

进行了很多次染色质免疫沉淀“ChIP”检测的研究人员(甚至是你的导师)可能会认同多克隆抗体优于单克隆抗体的看法。但这是否总是正确呢?

花时间来了解两者在抗原检测和特异性方面的差异,并揭开一些谜底是值得的。 

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主题: 抗体性能, ChIP, 抗体验证, 翻译后修饰, 可重复性

远离ChIP ?


Curtis D 发布于 2018 年 1 月 31 日 06:00:00

你的实验和数据一定让你走上了一条无法逃避的道路。你需要证明你的目的蛋白可以直接调节基因。你在心里暗想:“噢,ChIP……”

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主题: 实验步骤, 抗体性能, ChIP, 技术, 可重复性

需要更好的 ChIP 结果?使用酶解法


Carolyn P 发布于 2015 年 8 月 05 日 12:33:00

一次染色质免疫沉淀 (ChIP) 实验的成败高度取决于染色质和蛋白表位的完整性,因此你的染色质制备方法会对实验结果的质量产生重要影响。

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主题: 实验步骤, ChIP, 技术

4 个步骤获得更好的 ChIP 结果——第 4 步:下游分析


Carolyn P 发布于 2015 年 3 月 11 日 03:00:00

本系列的第 1 部分描述了在你的实验步骤中加入适当对照的重要性。在第 2 部分中,我们讨论了染色质制备如何影响最终实验结果。在接下来的帖子中,我们将探讨免疫沉淀抗体,现在我们从分析数据开始。

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主题: 实验步骤, ChIP, 技术

4 个步骤获得更好的 ChIP 结果——第 3 步:选择抗体


Carolyn P 发布于 2015 年 3 月 04 日 03:00:00

本系列的第 1 部分描述了在你的实验步骤中加入适当对照的重要性。在第 2 部分中,我们讨论了染色质制备如何影响最终实验结果。现在,我们花点时间来考虑免疫沉淀抗体。

对目的靶标不具有高度特异性的抗体可能会出现不可预见的结合,并增加背景噪声,从而增加了检测低丰度或低稳定性相互作用的难度。

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主题: 实验步骤, ChIP, 技术

4 个步骤获得更好的 ChIP 结果——第 2 步:精确制备


Carolyn P 发布于 2015 年 2 月 25 日 03:00:00

本系列的第 1 部分描述了在你的实验步骤中加入适当对照的重要性。现在,我们将讨论染色质制备会如何影响最终实验结果。

首先考虑你要检测的相互作用类型:

  • 高频率、非常稳定的蛋白与 DNA 之间的相互作用(如组蛋白与 DNA 之间的相互作用)发生频率高,即使实验步骤未经完全优化也能检测到。
  • 如果实验步骤不能确保蛋白和 DNA 的完整性,或如果使用了对目的靶标不具有高度特异性的抗体,则低频率且较不稳定的相互作用(比如多梳蛋白家族与特定基因 [例如 Ezh2] 的结合)就可能会低于检测阈值。

现在,是时候考虑你制备染色质的方案了... ...

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主题: 实验步骤, ChIP, 技术

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